Interní audit pomáhá účetní jednotce k zlepšení efektivnosti řídících a kontrolních procesů. Může mít nejrůznější cíle i rozsah v závislosti na velikosti a struktuře účetní jednotky a konkrétních požadavcích vedení (např. ověření účinnosti vnitřního kontrolního systému, ověření finančního řízení, prověření finančních a provozních informací apod.). Cena interního auditu se stanovuje obdobným způsobem jako cena statutárního auditu.